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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
23/05/2007 |
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Data da última atualização: |
24/05/2007 |
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Autoria: |
BARBOSA, S. R. C.; GOMES, E.; BRESEGHELO, L.; MOURA, A. L. D.; ALVES, E. B.; KNOB, A.; ALMEIDA, A. M. R.; LOBO JUNIOR, M.; PETROFEZA, S. |
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Título: |
Análise parcial do transcriptoma de Sclerotinia sclerotiorum durante a interação patogênica com feijão comum (Phaseolus vulgaris L.). |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE GENÉTICA, 12., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Área Microorganismos - pdf 898. |
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Conteúdo: |
No Brasil, perdas na produção de diversas culturas causadas por Sclerotinia sclerotiorum vêm chamando a atenção de produtores e pesquisadores, como em lavouras de feijão e soja, irrigadas por pivô central em diversas regiões do país. Dentre as culturas comerciais afetadas, a do feijoeiro é a que mais sofre perdas na produção, sendo o número de sementes por planta e seu peso os componentes de rendimento mais afetados trazendo enorme prejuízo. O interesse em genes de fungos diferencialmente expressos durante a interação com a planta hospedeira é nutrido pela idéia que tais genes podem desempenhar um papel crucial durante o desenvolvimento da patologia. Neste sentido este trabalho objetivou a identificação e a análise de genes de S. sclerotiorum que são expressos preferentemente durante sua interação com a planta de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L) o pode permitir a detecção de genes que são potencialmente importantes para o processo de patogênese em cada uma das fases consideradas. Os bancos de cDNA foram construídos no vetor uni-direcional e de expressão ?ZAP a partir de S. sclerotiorum crescido em meio BDA (condição normal) e de S. sclerotiorum durante a infecção em plântulas de feijoeiro Os cDNAs clonados nestes fagos foram isolados e amplificados por PCR, sendo o produto submetido direto ao seqüenciamento da região 5'.Os eletroferogramas foram analisadas pelo programa PHRED e as seqüências correspondentes aos vetores foram mascaradas através do programa CrossMatch. Somente as seqüências que apresentaram um tamanho acima de 200 nucleotídeos, com índice PHRED maior do que 20 foram selecionadas. As ESTs foram agrupadas utilizando o programa CAP3 sendo que as seqüências similares formaram um contig, que era representado por uma única seqüência consenso, e os singlets, seqüências unitárias que não apresentaram similaridade com nenhuma outra seqüência.Um total de 1860 ESTs foram geradas, sendo 940 da condição Normal e 920 seqüências da interação sclerotinia-feijoeiro. Destas foram consideradas apenas seqüências de ESTs que apresentaram um E value < 10-5, correspondendo a 58,51% e 46,74% do total de ESTs seqüenciadas da condição normal e interação, respectivamente. A subtração eletrônica de ESTs foi feita utilizando as seqüências da condição normal e seqüências da interação de S. sclerotiorum-feijoeiro. Os genes diferencialmente expressos foram obtidos considerando-se os contigs formados exclusivamente por normal ou interação. As seqüências consenso dos contigs e os singlets, foram comparadas com seqüências de outros organismos, utilizando o BLASTx e os bancos de dados GenBank nr; COG (Cluster of Orthologous Groups), GO (Gene Ontology) e MIPs (Munich Information Center for Proteins Sequences). As seqüências foram categorizadas e suas possíveis funções inferidas por analogia com outras depositadas nos bancos de dados. MenosNo Brasil, perdas na produção de diversas culturas causadas por Sclerotinia sclerotiorum vêm chamando a atenção de produtores e pesquisadores, como em lavouras de feijão e soja, irrigadas por pivô central em diversas regiões do país. Dentre as culturas comerciais afetadas, a do feijoeiro é a que mais sofre perdas na produção, sendo o número de sementes por planta e seu peso os componentes de rendimento mais afetados trazendo enorme prejuízo. O interesse em genes de fungos diferencialmente expressos durante a interação com a planta hospedeira é nutrido pela idéia que tais genes podem desempenhar um papel crucial durante o desenvolvimento da patologia. Neste sentido este trabalho objetivou a identificação e a análise de genes de S. sclerotiorum que são expressos preferentemente durante sua interação com a planta de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L) o pode permitir a detecção de genes que são potencialmente importantes para o processo de patogênese em cada uma das fases consideradas. Os bancos de cDNA foram construídos no vetor uni-direcional e de expressão ?ZAP a partir de S. sclerotiorum crescido em meio BDA (condição normal) e de S. sclerotiorum durante a infecção em plântulas de feijoeiro Os cDNAs clonados nestes fagos foram isolados e amplificados por PCR, sendo o produto submetido direto ao seqüenciamento da região 5'.Os eletroferogramas foram analisadas pelo programa PHRED e as seqüências correspondentes aos vetores foram mascaradas através do programa CrossMatch. Somente... Mostrar Tudo |
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520 $aNo Brasil, perdas na produção de diversas culturas causadas por Sclerotinia sclerotiorum vêm chamando a atenção de produtores e pesquisadores, como em lavouras de feijão e soja, irrigadas por pivô central em diversas regiões do país. Dentre as culturas comerciais afetadas, a do feijoeiro é a que mais sofre perdas na produção, sendo o número de sementes por planta e seu peso os componentes de rendimento mais afetados trazendo enorme prejuízo. O interesse em genes de fungos diferencialmente expressos durante a interação com a planta hospedeira é nutrido pela idéia que tais genes podem desempenhar um papel crucial durante o desenvolvimento da patologia. Neste sentido este trabalho objetivou a identificação e a análise de genes de S. sclerotiorum que são expressos preferentemente durante sua interação com a planta de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L) o pode permitir a detecção de genes que são potencialmente importantes para o processo de patogênese em cada uma das fases consideradas. Os bancos de cDNA foram construídos no vetor uni-direcional e de expressão ?ZAP a partir de S. sclerotiorum crescido em meio BDA (condição normal) e de S. sclerotiorum durante a infecção em plântulas de feijoeiro Os cDNAs clonados nestes fagos foram isolados e amplificados por PCR, sendo o produto submetido direto ao seqüenciamento da região 5'.Os eletroferogramas foram analisadas pelo programa PHRED e as seqüências correspondentes aos vetores foram mascaradas através do programa CrossMatch. Somente as seqüências que apresentaram um tamanho acima de 200 nucleotídeos, com índice PHRED maior do que 20 foram selecionadas. As ESTs foram agrupadas utilizando o programa CAP3 sendo que as seqüências similares formaram um contig, que era representado por uma única seqüência consenso, e os singlets, seqüências unitárias que não apresentaram similaridade com nenhuma outra seqüência.Um total de 1860 ESTs foram geradas, sendo 940 da condição Normal e 920 seqüências da interação sclerotinia-feijoeiro. Destas foram consideradas apenas seqüências de ESTs que apresentaram um E value < 10-5, correspondendo a 58,51% e 46,74% do total de ESTs seqüenciadas da condição normal e interação, respectivamente. A subtração eletrônica de ESTs foi feita utilizando as seqüências da condição normal e seqüências da interação de S. sclerotiorum-feijoeiro. Os genes diferencialmente expressos foram obtidos considerando-se os contigs formados exclusivamente por normal ou interação. As seqüências consenso dos contigs e os singlets, foram comparadas com seqüências de outros organismos, utilizando o BLASTx e os bancos de dados GenBank nr; COG (Cluster of Orthologous Groups), GO (Gene Ontology) e MIPs (Munich Information Center for Proteins Sequences). As seqüências foram categorizadas e suas possíveis funções inferidas por analogia com outras depositadas nos bancos de dados.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 4 | |
| 2. |  | BARBOSA, S. R. C.; GOMES, E.; BRESEGHELO, L.; MOURA, A. L. D.; ALVES, E. B.; KNOB, A.; ALMEIDA, A. M. R.; LOBO JUNIOR, M.; PETROFEZA, S. Análise parcial do transcriptoma de Sclerotinia sclerotiorum durante a interação patogênica com feijão comum (Phaseolus vulgaris L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE GENÉTICA, 12., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. 1 CD-ROM. Área Microorganismos - pdf 898.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 3. | | SANTOS. C. A. dos; KRAWULSKI, C. C.; BINI, D.; GOULART FILHO, T.; KNOB, A.; MEDINA, C. C.; ANDRADE FILHO, G.; NOGUEIRA, M. A. Reclamation status of a degraded pasture based on soil health indicators. Scientia Agrícola, Piracicaba, v. 72, n. 3, p. 195-202, May/Jun. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 4. | | KUWANO, B. H.; KNOB, A.; FAGOTTI, D. S. L.; MELEM JUNIOR, N. J.; GODOY, L.; DIEHL, R. C.; KRAWULSKI, C. C.; ANDRADE FILHO, G.; ZANGARO FILHO, W.; TAVARES FILHO, J.; NOGUEIRA, M. A. Soil quality indicators in a rhodic kandiudult under different uses in northern Parana, Brazil. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, MG, v. 38, p. 50-59, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Soja. |
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